Keberadaan Politeknik Piksi Ganesha Indonesia berawal dari obsesi para tokoh yayasan Bhineka Karya yang berdiri tanggal 17 Mei 2002 di Karanganyar dengan SK MENDIKNAS NO. 99/D/O/2002. Saat itu didirikan perguruan tinggi bernama Politeknik Dharma Patria Kebumen dengan menggunakan gedung SMK Bhina Karya 2 Karanganyar, yang masih satu yayasan dengan Bhineka Karya. Politeknik Dharma Patria Kebumen sendiri mempunyai 4 (empat) jurusan, yaitu Akuntansi, Teknik Elektronika, Teknik Mesin dan Teknik Otomotif. Peningkatan mahasiswa Politeknik Dharma Patria Kebumen dari tahun ke tahun cenderung meningkat, namun pada tahun 2011 terjadi konflik antar pengurus yayasan dan sampai akhirnya pada tahun 2011 Politeknik Dharma Patria Kebumen diakuisisi Politeknik Piksi Ganesha Bandung yang terletak di pusat kota kebumen yaitu di jalan Jendral Ahmad Yani No. 1 Kebumen.

Pada bulan April 2011, mulailah pembukaan penerimaan mahasiswa baru. Dengan manajemen yang baru dan tidak kurang juga dari promosi, maka peminat calon mahasiswa baru sangat banyak dan ini peningkatan yang sangat signifikan di banding manajemen lama. Masyarakat, khususnya yang baru lulus SLTA sangat antusias sekali untuk mendaftar di kampus Politeknik Dharma Patria Kebumen. Bahkan bukan dari yang baru lulus SLTA saja, melainkan dari para pejabat desa seperti Lurah, Sekretaris Lurah, Kepala Desa serta Guru-Guru yang masih berpendidikan SMA, tertarik untuk mendaftar di Politeknik Dharma Patria Kebumen.

Untuk menunjukan komitmennya, pada tanggal 14 November 2012 lembaga telah meresmikan Gedung Rektorat Politeknik Dharma Patria Kebumen yang terletak di jalan Letjend Suprapto No. 73 Kebumen (samping Koramil Kebumen). Setelah peresmian kampus Politeknik Dharma Patria Kebumen, langsung kedatangan Asesor dari BAN-PT untuk visitasi akreditasi yang berlangsung selama 10 hari. Politeknik Dharma Patria pada tanggal 16 Oktober 2021 resmi berganti nama menjadi Politeknik Piksi Ganesha Indonesia. Proses penyerahan surat keterangan perubahan nama dilakukan oleh Ketua Yayasan Piksi Ganesha Indonesia, Dr. K.H. Prihartono, A.H., Drs., S.Sos., M.Kom., M.M kepada Direktur Politeknik Piksi Ganesha.